lncRNA测序


项目介绍

    长链非编码RNAsLong non-coding RNAsLncRNAs)是一类转录本长度大于200 nt且不编码蛋白质的RNAs(不含rRNA),广泛存在于各种生物体内。哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是LncRNA(相应的蛋白编码RNA比例是1%)。近年来研究表明,LncRNA参与了多种重要的调控过程,如X染色体沉默、基因组印记及染色质修饰等。通过LncRNA测序,可以快速获得与其生物学过程或者疾病相关的LncRNA的表达变化,从而促进LncRNA的深入研究。




实验流程图


分析内容


案例介绍(报告下载)

样品需求

1. 对于需要进行RNA抽提的样品,请使用新鲜取样的实验材料,当场分成小块后立即用液氮或干冰乙醇速冻,保存于-80°C冰箱,埋于足量的干冰中用保温箱寄送。对于用RNA组织保存液寄送的样品,请按照RNA组织保存液说明保存和寄送。对于部分特殊样品,可以将组织在液氮中研磨后用TRIzol悬浮后用普通冰袋寄送,具体情况请先沟通技术支持人员。

2. 对于细胞样品,送样量需达到107(10的7次方)数量级。富集后用RNA组织保存液保存和寄送。另外,也可将富集到的细胞置于2ml Ep管中,用1ml TRIzol重悬,埋于足量的干冰中用保温箱寄送。

3. 对于血液样本,仅接收未冻存过的抗凝血新鲜样本。抗凝剂不可使用肝素钠,可用EDTA或ACD抗凝剂,取血后以冰袋保存,切记不能使血液冻结,从取血之时开始计算,须在72小时之内送达生工上海总部高通量测序部。如果不能提供新鲜样本,则请提供从血液中提取的总RNA样本。

4. 对于微生物样品,请客户如实声明所属物种;对于可能致病的微生物,生工保留拒收的权利。细菌样品送样量需至少达到107(10的7次方)数量级,将细菌富集后,用液氮或干冰乙醇速冻,保存于-80°C冰箱,埋于足量干冰寄送。

常见问题

问:LncRNA测序的必备条件是什么?

答:必须有参考基因组,并且有LncRNA注释信息:常见的包括人、小鼠、大鼠、猪、牛、兔、斑马鱼、酵母、拟南芥、果蝇、秀丽线虫;拟南芥、玉米、葡萄、金银花、水稻、西红柿、大豆。