简化基因组测序


项目介绍

    通过限制性内切酶对基因组DNA进行酶切,并对酶切片段进行高通量测序,这种通过酶切降低基因组的复杂度的测序技术统称为简化基因组测序技术。利用生物信息学方法,进行SNP单体型图谱绘制,全基因组关联分析(GWAS),连锁分析和QTL定位分析,种群进化,主成分分析等。比较有代表性的方法有GBS-seq和RAD-seq。



实验流程图

案例介绍(报告下载)

样品需求

1. 如果客户是送DNA样品,建议浓度大于10ng/uL,总量1-2ug,以Qubit 2.0检测结果为准。OD260/280=1.8,电泳检测无明显弥散。

常见问题

问:如何选择限制性内切酶?

答:可以通过对基因组进行电子酶切结合预期的标签数确定合适的酶,对于无参物种则可选用其近缘物种基因组序列进行电子酶切。

问:标签平均测序深度是多少?

答:为了保证包括杂合位点的可靠性,建议测序深度大于30X。

问:你们公司可以提供哪些类型的简化基因组测序项目?

答:我们公司目前可以提供GBS和RAD-Seq两种测序方法。