高通量测序技术及平台介绍


    高通量测序技术是可以平行对数百万甚至数十亿条序列测序的技术。在基因组测序、转录组测序、宏基因组测序、表观遗传测序、外显子捕获测序、靶区域测序等诸多科研及精准医疗检测领域内有广泛的运用。

    生工生物工程(上海)股份有限公司自2012年成立高通量测序部以来,逐步引进了Illumina,Life,PacBio等二代/三代测序平台。建立了2000m2高标准实验室(通过了国家ISO认证)以及10PB级运算能力的服务器集群,能满足绝大多数科研客户的研究需要。同时,生工高通量测序团队建设也在不断完善中,目前有50余专职员工,其中高级技术人员以及高级生物信息工程师占比50%以上,5年来,通过生工高通量测序结果发表的文章累计影响因子超过1000分以上。

    Illumina HiSeq2500/4000 可运行PE150/PE250模式,可承担转录组测序、人基因组重测序、外显子捕获测序、宏基因组测序、微生物分类测序等服务;

    Illumina MiSeq 运行PE300模式,可以承担细菌基因组重测序/De novo测序、微生物分类测序、扩增子测序、核酸适配体测序等服务;

    Life Ion torrentPGM 运行314、316、318芯片,可以承接扩增子测序、靶区域测序、基因组重测序服务;

    PacBio Sequel/RSII 该测序平台读长超长,平均可达10kb以上,主要承接细菌基因组完成图测序、真菌基因组精细图测序、全长转录本测序等服务;

    Life Ion torrentPGM 运行314、316、318芯片,可以承接扩增子测序、靶区域测序、基因组重测序服务;

    PacBio Sequel/RSII 该测序平台读长超长,平均可达10kb以上,主要承接细菌基因组完成图测序、真菌基因组精细图测序、全长转录本测序等服务;


检测设备

Illumina MiSeq

1台

运行模式

PE300bp

运行周期及数据量

60h/Run,20M Reads/Run